Музей истории при ФГБУ «НМИЦ им. ак. Е.Н. Мешалкина Минздрава России содержит более пяти тысяч предметов, где представлены материалы о личности и деятельности основателя Научного Центра, ученого, хирурга и основоположника кардиохирургии в Сибири, академика Е.Н. Мешалкина, а также предметы и инструменты, демонстрирующие развитие отдельных направлений в кардиохирургии, эволюцию подходов к выполнению операций на сердце в Сибири и в России в целом.
В музее представлена крупнейшая в России экспозиция, посвященная истории искусственного кровообращения.
В рамках экскурсионной программы посетителям представится возможность посетить библиотеку, а также предложен к показу фильм об основателе Института патологии и кровообращения докторе медицинских наук, профессоре Е.Н. Мешалкине.